BTS alternance probleme avec l employeur

Bonjour,
Je suis en contrat de professionnalisation cela fait un an. Je suis en conflit avec l employeur je me suis mise en arret maladie. Mais je ne sait pas quoi faire par rapport a l ecole car les directeurs de l ecole m appelle pour rompre le contrat avec eux. Mais moi je veut pas tout perdre. Y aurais t il une solution pour que l employeur me fasse signer une rupture a l amiable ou que se soit lui qui me licencie pour que je puisse toucher le chomage. Merci.