Soucis fiche de paie

Bonjour j'ai un soucis, cela fait des années que je n'enlève pas les prime de paniers ni de trajet de mes fiches de paie ( je ne le savais pas voilà ????)... Sauf que en faite ces primes sont comptées dans mon salaire !!!! Alors que les gens autour de moi non, du coup je ne comprends pas. J'ai par exemple un peu plus de 200e de prime de panier, 150e de prime de trajet chaque mois et j'ai en plus des tickets resto ( que je paie). Comment je m'y retrouve car on me dit que mon patron fait n'importe quoi alors que c'est une grosse société il a 3 comptables. Merci de m'éclairer,