Malfaçon toiture

Bonjour,
Je fais rénover une maison . Pour suivre les travaux et trouver les artisans j'ai pris un maître d'oeuvre.
Les maçons ont refait un toit . Ils ont posé de la canalite avec par dessus des tuiles canal. Un velux a également été mis en place par un poseur agrée. Le soucis se situe au niveau du velux. L'étanchéité du velux a été faite sur la canalite et pas sur la tuile canal ce qui veut dire que l'eau s'écoule entre la canalite et la canal . En fait le velux est trop encastré dans la toiture.Les maçons et le poseur de velux se sont concertés et il en ressort que la faute vient des maçons.
Le poseur de velux va essayer de trouver une solution pour mettre l'étanchéité sur la canal, mais ça restera toujours du bidouillage.
Ma question est la suivante : si cette solution ne me convient pas ou est inesthétique que dois je faire.
Dans le cas d'une rénovation puis je demander au maître d'oeuvre le document du parfait achèvement des travaux
Cordialement