Prise en charge des frais de transport

Bonjour

Je voulais savoir si mon employeur pouvait bien prendre en charge des frais de transport alors que je dispose d'une voiture de fonction.
Salarié depuis 4 ans de mon entreprise je bénéficie d'une voiture de fonction parce que je devais me rendre sur plusieurs sites dans les département du 77, 93, 91.

Depuis le 1er janvier j'ai été affecté sans modification de mon contrat de travail sur un site dans le 92, après plusieurs essaies, il est plus facile pour moi de m'y rendre en transport que d'utilise ma voiture de fonction(1h avec les transport, et entre 2h et 3 h en voiture), mon employeur me dit qu'il ne peux pas prendre en charge les frais lié au transport en commun.
Sachant que je me rend pas si un des sites qui se trouve sur mon contrat de travail.

Merci d'avance pour vos réponses