Actuellement en arrêt maladie suite à une ptei

Bonjour,
Je viens d être opérer de l épaule droite le chirurgien m'a mis une Ptei. J'ai demandé à mon médecin traitant une demande de maladie professionnelle. Actuellement je poursuit ma reeducation sachant qu'il faut compter 6 mois d arrêt de travail. A quel moment la secu reconnaît la maladie professionnelle. Prend elle sa décision à la fin des soins ou avant ?