Franchise assurance habitation en cas de catastrophe naturelle

Bonjour,
suite à une déclaration en catastrophe naturelle sécheresse, ma maison d'habitation doit subir des réparations en deux phases, à un an d'intervalle.
l'assurance tiendra compte de la franchise dès le début des travaux ; l'indemnisation pour la première phase serait donc réduite de cette franchise.
puis-je exiger que cette franchise ne soit déduite qu'à la fin des travaux ?
en vous remerciant,
cordialement,
A.Fornel