Chômage partiel et reprise du travail

bonjour,
mon entreprise va ré ouvrir or j'ai deux maladies auto immunes avec un traitement immuno modulateur ? que dois je faire pour ne pas reprendre tout de suite. Les clients ne sont pas au rendez-vous la plupart annulent aussi je sais que mon entreprise va être obligée de garder certains employés en chômage partie, du fait de mon poste je suis prioritaire pour rentrer mais travaillant avec des clients qui viennent de la France entière je préfère éviter.
je ne sais pas si vous pouvez répondre à ma question un certificat de mon médecin traitant suffit ou faut-il voir la médecine du travail.
merci d' avance pour votre réponse