Déclaration

Bonjour,
J’ai travaillé dans une entreprise japonais pendant 3 ans, et je suis arrivé en France il y a 1 ans et demi pour créer la branche française de mon entreprise japonaise.
Afin de pouvoir faire un essai, j’ai d’abord créé une auto entreprise afin de générer un premier bénéfice, pour pouvoir ensuite créer une SAS.
Cela dit, l’entreprise japonaise souhaitant officialiser le statut de branche, nous avons décidé de verser un capital tout les mois sur l’auto-entreprise, et n’ayant pas beaucoup de clients, cela me permettait également de vivre.
J’ai toujours déclaré et payés les 33% de cotisations lors de ma facturation client,
mais considèrent ceci comme un capital de l’entreprise, je n’ai pas déclaré ces versements (et donc pas payés les 33%).
Avec le temps je commence à m’inquiéter ayant peur d’être dans l’illégalité, le suis-je ?
Si oui comment régulariser ma situation ?
Finalement je n’ai eu que 2 clients, je n’ai donc pas profité du statut auto entrepreneur et je suis prêt à clôturer le statut si besoin est.
Je suis encore jeune je ne souhaiterais juste pas être endetté à cause de ça...
Merci de votre aide.