Arrêt de travail d'un employé à 90 %

Bonjour,
Je suis à 90 % de ton travail depuis plusieurs années suite à une demande pour avoir mes mercredi après-midi pour les enfants.
je suis depuis quelques jours et cela pour 3 mois en arrêt de travail.
Ma question est la suivante :
Est-ce que le calcul de mes indemnités pendant mon arrêt de travail seront comptées sur la base des 90 % ou des 100 % ?
En sachant que a la base je suis un employé à temps complet c'est une dérogation que j'ai pour quelques années