Avertissement suite à un arrêt de travail

Bonjour,
Je suis en CDI, je n'ai toujours pas passé ma visite médicale et suis engagé depuis plus de 3mois.
Je suis en arrêt de travail suite à des problèmes de tensions, mon employeur dit ne pas avoir reçu mon 1er arrêt de travail et la Sécu l'à bizarrement perdu...bref. Je me retrouve aujourd'hui, le 12/12, a recevoir un recommandé ET un courrier simple me signifiant un avertissement pour ne pas avoir envoyer mes justificatifs d'absence du 05/12 au 14/12 (il y a eu 2 arrêts, l’initial apparemment non reçu et la prolongation envoyé le 10/12).
Quels sont mes recours? Ont-ils le droit de me mettre un avertissement alors que j'ai prévenu mon responsable par texto de mon absence et que j'ai envoyé mes arrêts? Ont-ils le droit "d'antidater" mes absences (recommandé reçu le 12/12 pour une absence allant jusqu'au 14/12)?
Merci à vous.