CP et 36h sur la même semaine

Bonjour,

Je suis infirmière et nous sommes plusieurs à avoir basculé sur un planning de 12h. À la suite d’un changement de cadre (3 en 1 an ) et la mise en place d’un logiciel de compteur d’heures avec la mise au rebut de notre éternel classeur, nous nous apercevons d’une perte de CP et d’heures sup non majorées. Je m’explique, travaillant sur un établissement privé et au bloc opératoire, nos plannings en 12 h sont élaborés en fonctions des besoins de la direction et nous sont transmis aléatoirement d’1 mois sur l’autre. Nous travaillons 3jours, donc 36 heures hebdomadaires et devons déclarer l’heure hebdomadaire supplémentaire. Toutefois elle n’apparaît pas dans nos compteurs d’heures en heure sup augmentée de 25% celle ci doit bien être majorée ? Ils nous disent que oui mais rien n’est mis en évidence ! 
De plus la plus part du temps notre planning est élaboré après la pose de nos congés payés, de ce fait on peu perdre jusqu’à 2 jours de congés payés. Par exemple lorsque l’on pose 1 semaine de congés notre planning nous fait reprendre le mercredi donc en plus des 6 CP posés on nous déduit 2 CP (lundi mardi ) supplémentaires puis on enchaîne sur 36 heures. Donc en 1 semaine on cumul 2CP et 36 h ? Est ce legal ? Nous sommes perdantes ! On comprend la légalité concernant le fait que les CP S’arrêtent la veille de la reprise , mais on fait nos heures et sur la même semaine on nous déduit 1 ou 2 CP ?  Avec ce système j’ai déjà perdu 4 CP depuis mai en n’ayant pris que 3 semaines de CP non consécutives.  Quel texte de loi légifère sur le sujet ? 
Merci pour vos réponses.