Absence injustifiée justifiee

Bonjour,

Étant dans mon 7eme mois de grossesse et au vu de la situation actuelle (covid 19), je fais partie des personnes qui doivent être impérativement arrêtées selon le communiqué du Conseil de la sante.
J'ai lancé la procédure sur le site officiel en prenant soin d'envoyer le lien à mon employeur pour lui prouver que j'ai fais la procédure, cependant le sécu ne m'as toujours pas envoyé le volet 3 que je dois transmettre à mon employeur.
Du coup, mon employeur me dit que cela sera compter comme absence injustifiée si je ne lui transmet pas le volet demandé .
Est ce légal au vu du contexte ?