Paiement HT ou TTC

Bonjour,
Je suis actuellement un stagiaire au sein d'un institut de recherche qui a la forme juridique d'une association qui est exonérée de la TVA, pourtant elle effectue des achats pour le biais de la réalisation des recherches et je voulais savoir si elle doit payer ces achats HT ou TTC ?
Je vous serai très reconnaissant