Stage à effectuer et congés refusés

Bonjour,
J'ai 20 et je suis étudiant en prépa intégré et j ai un stage à effectuer au mois de mars de 2 semaines. En parallèle de mes études je travaille dans la restauration rapide pour payer mes frais de scolarité.
En sachant que mon stage tombait pendant les jours où je travaillais on m a dit de poser des congés payés.
Malheureusement ils n'ont pas été tous acceptés. Résultat pendant 3 jours je ne pourrais être présent au travail, qu'est ce que je risque ? Comment faire pour éviter d'être licencier ? Car ce stage est obligatoire pour que je valide mon année, et je l'effectue à + de 150 km de mon lieu de travail.
Je ne sais pas comment faire ... Je suis un petit peu perdu par la situation, moi qui pensait que tout était ok.