Indemnites IJSS

Bonjour
Je suis arrêtée depuis le 5 janvier 2017 dernier pour accident de trajet
Un dossier maladie professionnelle a été ouvert au 14 mars 2017 pour maladie professionnelle
Mon employeur à jusque là fait un maintien de salaire car a fait joué la subrogation
Aujourd'hui il me demande de lui verser un trop perçu de 2000 Euros car m'indique que la CPAM a traité le dossier en maladie et non accident de trajet.
Vu avec mon médecin traitant qui s'est mis en relation directe avec le médecin conseil de la CPAM confirmant la prise en charge en tant qu'accident de trajet jusqu'au 14 mars 2017. Le dossier prévoyance n'avait pas été jusque là envoyé du au fait des tous les changements et a été fait seulement hier. De plus j'ai reçu 2 bulletins de salaire pour avril 2017 de la part de mon employeur (un pour un mois de salaire normal, l'autre avec un écart de 1154 euros d'écart par rapport au premier)
question a t'il le droit de faire cela est ce normal
Merci pour votre retour