Refus en bloc de la déduction fiscale

Bonjour,
Notre SCI familiale NON SOUMISE à I.S.
a acquis l'ancien bureau (au rez de la copropriété) vétuste d'une Banque qui s'en est "débarrassé" ; l'intérieur n'avait jamais été "rajeuni" depuis 40 ans (sic)
Donc, à part les planchers en bois de qualité, les murs intérieurs, les plafonds ... (sauf leur replâtrage et consolidation)
Nous dûmes effectuer > sans agrandir la surface au sol bien sûr
un fort entretien général (des parquets bois rayés ou certains fissurés) + les réparations des canalisations de distribution et d'évacuation des eaux + substitution de ancien chauffage "gaspilleur d'énergie" avec brûleur de 4o ans .....par système ECO gaines au sol pour chauffage avec variateur dans chaque bureau
(et ? ou ? amélioration / ?définition dans notre cas ? ou distinguo?)

PLUS la mise en conformité aux normes tant amiante (désamiantage), isolations phonique & thermique interne des parois + plafonds, des bureaux AVEC portes extérieures+ vitrages énergie+...) , accessibilité handicapés (notamment largeur des portes extérieures et intérieures+ création toilettes pour eux, etc ...)

DONC, notre expert-comptable inexten.., a déduit le coût de la totalité de ces travaux en 2014, sans nous donner d'explications ni nous prévenir d'éventuelles conséquences fiscales !?!

> L'Inspectrice locale vient février 2016</souligne> de nous rejeter, refuser en "bloc", la déduction fiscale "de la totalité desdits coûts de l'ensemble desdits travaux "

Depuis, grâce à votre intéressant site, je viens de me rendre compte que seuls l'entretien et les réparations, eussent pu être déductibles
(? mais lesquels alors ? d'après le genre de travaux ci-dessus ! )
coût faible par rapport au coût total de cette " rénovation " ... terme non utilisé par notre fisc .

Nous vous remercions de nous donner des éléments à votre réponse
tant quant aux "travaux de rénovation effectués" qu'à nos droits de déduction fiscale et de la responsabilité dudit comptable

Avec nos meilleures salutations.