Veranda illegale

Nous avons acheté une maison de 100 m2 en 1994. En plus de ces 100m2, il y avait une pergola couverte de 21 m2 que nous avons fermée dès l'acquisition avec 1 porte et 2 fenêtres. Cependant nous n'avons fait aucune déclaration de travaux faute de connaissance de la loi.Aujourd'hui, nous souhaitons changer la toiture pour y mettre des puits de lumière ( je pense que c'est de la rénovation puisQue le toît existait lors de l'achat). Mais nous voulons aussi remplacer les fenêtres et la porte par une grande baie coulissante de 5 m/2,15m).
Comment faire pour ne pas risquer de problèmes avec la loi? Faut-il faire une regularisation ( declaration de travaux pour regulariser les parties vitrées, attendre 1 mois la réponse. Puis immédiatement après, nouvelle declaration pour declarer changement de toiture et baies). Cette solution permettrait de commander la baie et la toiture en rénovation. Peut-on faire 2 déclarations dans delai de 2 ou 3 mois?
2 eme option ( conseillée par 1 artisan) : faire declaration en s'appuyant sur pergola non fermée de 1994
Quelles incidences la déclaration rectificative aura t- elle? Les impôts locaux vont-ils faire rappel? Sur combien d'années peuvent-ils le faire?
Peut-on faire détruire cette véranda? ( véritable pièce à vivre pour nous?)
Merci de vos réponses