Non versement de primes exceptionnelles

Bonjour,
Je suis à la recherche de conseils pour une situation délicate au travail.
Je suis commerciale dans une entreprise et ma rémunération habituelle est constituée d'un fixe et d'un variable en fonction de l'atteinte des objectifs fixés de manière régulière. Le versement des primes intervient au m+2 de la réalisation des objectifs.
Au mois de septembre, l'entreprise a confié des missions supplémentaires à un certain nombre de salariés dont je fais partie. Ces missions étant différentes de nos attributions contractuelles et très astreignantes, nous avons demandé une contrepartie.
Il nous a été proposé un aménagement de notre système de primes pour le mois de septembre. Cet aménagement a été communiqué par écrit (e-mail) mais n'a fait preuve d'aucun avenant. Il s'agissait d'adapter le seuil de déclenchement des primes au prorata du temps passé (défini par l'entreprise) sur les missions complémentaires.
Au début du mois d'octobre, nous avons reçu un nouveau plan de prime par e-mail, toujours sans avenant, visant à plafonner le nombre de paliers de prime accessibles pour le mois d'octobre, les seuils de déclenchement étant de nouveau adaptés.
Aujourd'hui, à l'approche de la rémunération supposée de ces missions du mois de septembre, l'entreprise revient sur cet aménagement et refuse de payer une partie des primes acquises. Ils nous expliquent donc que le plafonnement installé au mois d'octobre, sera rétroactif sur le mois de septembre. Ils se justifient en plaidant l'aberration économique du plan de septembre établi à la va-vite.
Je ne souhaite pas entrer en conflit avec mon employeur, mais j'aimerai tout de même récupérer l'intégralité des primes (ils souhaitent me verser 2900 euros au lieu de 7400) que j'ai déclenchées ou négocier une contrepartie, on parle tout de même de 4500 euros !
Y a-t-il un élément sur lequel je peux m'appuyer pour négocier ou sont-ils dans leur bon droit ? L'e-mail a-t-il une valeur légale ou seul un avenant peut faire foi ?
Je vous remercie d'avance pour les conseils que vous pourrez m'apporter.