VEFA - Modification du plan avant construction

Bonjour,
J'ai signé pour un appartement de 89 m² en VEFA (12/2012) dans un programme qui en est aujourd'hui à la fin des fondations.
Dès la réservation (04/2012), j'ai fait une demande au promoteur pour qu'il me dise dans quelles conditions il serait possible d'ajouter une lucarne (ou chien assis) dans une chambre, à l'identique de la lucarne prévue dans la chambre contiguë.
Je viens de recevoir du promoteur une réponse négative.

Ma demande s'inscrivait dans l'hypothèse qu'il était fort probable, d'après les services d'urbanisme de la Mairie, que le programme devrait nécessiter de toutes façons un Permis de Construire modificatif pour d'autres raisons, et que la Mairie n'avait pas d'objection à ma modification, celle-ci respectant le PLU.

L'argument qui m'est avancé par le promoteur est que cela créerait une surface habitable supplémentaire de 1,37 m² (1,37 m x 1 m), avec les conséquences suivantes :
- Le projet utilise la totalité du COS applicable (on passerait de 10000 m² habitables à 10001,3 m² !)
- l'augmentation de surface augmenterait mes millièmes de copropriété, et modifierait l'état descriptif de division du R.C.

Je voudrais savoir si cette modification, assimilable à une embrasure de fenêtre, conduit réellement une augmentation de surface habitable, compte tenu que :
- La loi Carrez n'étant pas applicable à une VEFA, est-ce que l'autre mode de calcul doit prendre en compte cette surface ?
- L'acte de vente prévoit une tolérance de +/- 5% (soit +/- 4,4 m²) et je ne pense pas que les variations de surfaces habituellement observées dans tous les programmes entrainent une mise à jour du R.C.
Vous remerciant par avance.