Duree arret de travail semaine jour ouvrable

Bonjour,
nous sommes sous le regime de la convention syntec dans notre entreprise au niveau de la réglementation et avons nos congés en jours ouvrables cad 30 jours (lundi au samedi);
Mais notre semaine s'effectue du lundi au vendredi et nous ne travaillons en principe jamais le samedi. Petite question, en cas d'abscence pour courte maladie, par exemple un jeudi et un vendredi, quelle devrait être la durée de l'arret maladie ? 2 jours ou 3 jours, doit il comprendre le samedi ? si oui quel pourrait etre la consequence, si le medecin a homis de le mettre puisque nous ne travaillons jamais le samedi ?
Merci par avance.