Puis-je laisser le père de mes enfants vivre dans la maison qui m'appartient ?

Bonjour

Voilà la situation elle est complexe.
J'ai acheté une maison seule, après j'ai rencontré mon concubin et nous avons eu deux enfants, actuellement 3 et 5 ans.
Mon concubin a fait un prêt à son nom n'étant pas propriétaire de la maison,je me suis portée garante du prêt pour pouvoir rénover la maison.

À ce jour nous sommes en phase de séparation, j ai donc pris un autre logement en location.
Pour l instant je laisse le papa des enfants vivre dans ma maison, le temps que la séparation se mette en place
Dois-je établir un contrat de location ou tout autre document faisant fois qu'il occupe le logement à titre gratuit?

Merci