Reprise par le propriétaire d'un bien détenu en sci pour l'occuper

Bonjour,
Je suis propriétaire d'une habitation que je loue à mon locataire par le biais d'une SCI.
La SCI a emprunté pour acquérir le bien et effectué des travaux qui ont généré des déficits fonciers depuis sa création.
Je veux occuper maintenant ce bien à titre personnel car je suis en couple avec mon locataire depuis peu.
Que dois-je faire au niveau fiscal ?
Si la SCI ne génère plus de revenus au titre des loyers et que je prend en charge les mensualités de l'emprunt à titre personnel, que dois-je faire pour sortir de ce principe de revenus fonciers ? Y-a-t-il un risque de reprise par les Impôts pour les années antérieures ?
Si oui, lequel ?
Merci de votre réflexion et votre aide.