ARE inaptitude médicale et arrêt de travail

Bonjour, j'ai une question
je dois faire en septembre une rupture pour inaptitude médicale avec mon employeur , j'ai travaillé 6 mois en 2015 mon employeur à déclaré aux impôts 13000 euros et la cpam 13000 euros pour un arrêt de travail de 6 mois avec deux mi temps thérapeutique.
sachant que la cpam paie mes IJ directement à mon patron et le délais de carence est pris en charge par celui ci .
je gagne 28062 par an .
ma question est simple pour le calcul de l'are , le pôle va prendre en charge mon salaire annuel brute ou la déclaration de mon patron les 13000 euros et rien pour celle de la sécurité sociale ou il prendra en charge pour les deux POUR 2015 par rapport aux impôts ? merci pour votre réponse car je ne trouve rien sur le net .