Bail de droit commun

Bonjour, j'ai un bail de location pour ma résidence principale non meublée qui ne me semble pas très légal. Ce bail se décompose en deux parties:
1) Une partie intitulée Bail de droit commun non soumis par la loi du 06/07/89 modifiée par la loi du 21/07/94 - conditions particulières
2) Une partie intitulée Bail d'habitation - Loi du 6 juillet 1989 modifié par la loi du 21 juillet 1994 - Conditions générales
Du coup, ce n'est déjà pas très clair...
Ce contrat a été établi pour une durée d'un an en 2013. Dans l'article sur la fin de bail il est écrit que "A défaut de congé ou de renouvellement exprès, le bail est reconduit tacitement pour trois ans pour un bailleur physique...". Selon moi, le bail a donc été tacitement reconduit pour trois ans en 2014 à la fin de la première année de location, ce qui nous emmène jusqu'en 2017.
J'ai reçu hier un appel de l'agence immobilière qui m'indique que le propriétaire donne son congé et souhaite récupérer les lieux pour 2016. Selon l'agence, le contrat se termine bien en 2016. Quelqu'un aurait-il été confronté à la même situation et saurait-il pourquoi l'agence aurait raison ?
Merci d'avance,