Absence médicale

Bonjour,
Voila je souhaiterais avoir quelques explications svp.
Je suis employé en CDI et je dois bientôt subir une intervention médicale qui me laissera indisponible pour environ 4-6 semaines.
J'envisage de discuter avec ma hiérarchie afin de trouver le moment adéquat afin de pouvoir m'absenter car je suis actuellement en mission chez un client.
Mon soucis est de savoir si pour ma période d'absence devra être considéré en congé non payé, ou défalquer des mes congés payés ou considérer en absence maladies ? Et dans ce dernier cas continuerai je a toucher mon salaire ?
J'ai beau chercher je trouve pas d'explications claires a ce sujet.
Merci d'avance pour vos contributions.