13ème mois

Bonjour,

Cette année, j'ai été en congés maternité (entre mi-mars et fin juillet).
Je travaille dans une association à but non lucratif et j'ai la chance d'avoir un 13ème mois payé de moitié en juin et l'autre en décembre.
Mon salaire complet a été maintenue durant mon congés (payé par subbrogation) mais ma prime du mois de juin a été diminué du fait de ce congés... est-ce légal ?
Après avoir demandé à mon directeur, il m'a répondu que la prime était calculé par rapport à mon salaire brut. Or, il a été négatif pendant mon congés parce que la SECU ne versait pas les indemnités de suite !
Je ne comprends plus rien... avez-vous des réponses à me donner ?

Merci d'avance !