Gros souci avec mon bailleur

Bonjour,

Voilà je suis confronter à un gros problème:
J'ai acheté un fond de commerce boulangerie-patisserie en 2006, lors de la signature un avenant au bail à été rédigé pour donner 2 réserves dont je n'avais pas l'utilité au propriétaire. Ayant signé une procuration au notaire je n'ai pas assisté à la signature de cette avenant! Et il à été ajouter à mon insu le code 606 dans cet avenant.
Aujourd'hui, le propriétaire à transformer les réserves en appartements sans aucun permis de construire et les normes de sécurité dans les parties communes ne sont pas respectées (absence d'armoire coupe feu pour les compteurs, 3 appartements reliés sur un même compteur, fils électriques pendant dans les parties communes sans gaines, etc..)
Dans ce code 606 il semble que beaucoup de choses soit à ma charge mais étant donné que le propriétaire à maintenant transformé ce simple immeuble en immeuble collocatif, toutes les closes rentre-t-elles toujours en vigueur?
En attente d'une réponse précise je vous remercie d'avance pour votre aide.