Congés sans solde décompte t-on les dimanches ?

Bonjour, j'ai pris des congés sans soldes (2 semaines) car je suis actuellement en CIF et j'avais besoin de jours pour réviser mes cours et mes cp étaient épuisés. Mon employeur m'a enlevé 14 jours, il a compté les dimanches. Je suis en jours ouvrables, donc je pensais qu'on m'enlèverait 12 jours, de plus je ne travaille jamais les dimanches. Y a t-il une erreur ?