Contestation de solde de tout compte

Bonjour,
Mon conjoint a reçu son solde de tout compte mais l’employeur lui a déduit des sommes (on ne sait pas à quoi elles correspondent) sur ses congés payés. Sur son reçu il est bien marqué la somme du chèque, qui est contradictoire avec le reste quand il a mentionné le calcul de ses congés que l’employeur doit.

Peut-il encaisser son chèque et contester ensuite par LRAR ?

Merci pour votre réponse.