Heure de dimanche et annualisation

Bonjour, mon mari est passé en janvier en annualisation il travail dans une communauté de commune et a donc un statut de fonctionnaire.
On la mis a un nouveau poste (decheterie) ou il travail un week end sur 2. Le dimanche il travail 3h et est majoré a 166 pourcent.
J'aimerais savoir si les heures effectué le dimanche doivent etre deduite de son compteur d'heure de l'année?
merci d avance de votre réponse.