Démission sans préavis en accord avec mon employeur

Bonsoir,
Avec mon conjoint nous sommes muté en avril 2017. Je dois poser ma démission sachant que nous quittons la région. Je sais qu'avec ma démission j'aurai le droit au chômage.

Ma question est : avec mon patron on s'est mit d'accord que je peux prendre tous mes congés pendant mon préavis. Je vais le préciser sur ma lettre de démission en commun accord, ma période de congés sera confondue avec mon préavis. Est ce que pôle emploi peut ne pas ne vouloir me payer si je fais pas mon préavis ?
Merci