Retenue sur salaire en cas de temps de travail non réalisé

Bonjour,

Si un salarié d'une entreprise arrive avec retard, ou part plus tot et que ceci est prouvé par ex par une pointeuse, le fait de retirer le salaire correspondant proportionnellement au temps de travail non effectué ne risque -t-il pas d'empêcher par la suite une procédure de licenciement pour retards car la retenue sur salaire est déjà une sanction - et qu'on ne peut sanctionner deux fois pour un même problème ?

Merci pour votre réponse.
Cordialement