Remboursement frais de transport

Bonjour,
travaillant de nuit à 120km de mon domicile dans une association , j'ai payé pour le mois complet (JANVIER )le train et les réseaux de bus soit la somme de 274€10 les factures ont bien étés envoyées à l'heure.
Hors je m'aperçois ce jour en recevant mon bulletin de paie que
mon employeur ne m'a remboursé qu'une journée de transport ( 13€27 ) correspondant à ma seule nuit de travail , car j'ai eu un arrêt de travail le reste du mois de JANVIER! je ne pouvais pas prévoir d'être en arrêt !!
At-il le droit de déduire les jours d'arrêt?
MERCI de vos réponses
phil