Congés temps partielle

Bonsoir,
Je travaille a temps partielle, je ne travaille pas les mercredis, le gérant de la société a était remplacé depuis janvier. Avant (je travaille dans cette société depuis 15 ans !) quand je prenais le lundi et le mardi de congés et que je revenais le jeudi, le mercredi n'était pas décompté (décompté quand je prenais une semaine entière bien-sûr) et la surprise sur ma fiche de paie, le mercredi est décompté ! J'aimerais savoir si c'est légal ?
Merci d'avance de vos réponses....