Frais de travaux dans local professionnel

Bonjour,

J'ai acheté en tant que particulier un appartement dont j'ai fait un local professionnel et encaisse des loyers à ce titre que je déclare.
J'ai effectué des travaux : changement de fenêtres, porte + cloison isophonique pour garantir le secret professionnel.
L'administration fiscale réfute la déduction au motif que seuls sont acceptés les déductions des travaux au local professionnels pour l'accès handicapés et la détection d'amiante.
Il me semblait que tout particulier pouvait déduire des revenus fonciers les travaux effectués dans un appartement qu'il loue?
Merci de votre aide.