Prime de transport imposable à déduire ou pas

Bonjour,

Je viens vers vous après avoir été aux centre des impôts.
Chaque mois j'ai une prime de transport imposable pour un montant d'environ 100€. J'ai demandé si je pouvais déduire cette prime, on m'a dit de déduire mes frais réél, sans avoir besoin de justificatif sachant que j'utilise la voiture. Après avoir fait le calcul on m'annonce que pour 400€ de prime de transport je peux déduit 2200€ de frais liés à mes déplacements domicile travail.
Ca me parait énorme !
Sacahnt de plus que je suis en contrat de professionnalisation, je partage la semaine entre entreprise et école (presque à même distance). Du coup je ne vois pas comment faire. Je pensais qu'on déduisait automatiquement 10% du salaire imposable mais apparament non...

Je pensais changé de centre pour me renseigner mais je ne peux pas y aller avant le mois de juin ...
merci de votre aide