Autoentrepreneur: pb de factures...

Bonjour,
Nouvel autoentrepreneur, j'ai besoin de vos lumières, je viens de commencer et il y a certaines choses que j'ai du mal à comprendre. Je travaille dans le secteur du bâtiment et j'ai accepté de faire quelques travaux dans le nouvel appartement que je loue (changement de moquette dans une pièce, pause de carrelage dans une autre...). Le propriétaire m'a bien sûr précisé qu'il ferait appel à mon entreprise et m'a fait confiance. Là, j'ai donc avancé les frais de fournitures et je viens de lui envoyer deux factures à régler, une pour la main d'oeuvre et une autre concernant le matériel acheté. Or, le propriétaire souhaite absolument que je ne lui fasse qu'une seule facture au lieu des deux car il pourrait récupérer la tva dessus plus tard... Je lui ai précisé qu'en tant qu'autoentrepreneur, la TVA était non applicable me concernant mais il n'en démord pas, il ne souhaite qu'une seule facture. Si je ne fais qu'une seule facture que je déclare au RSI je devrais donc payer des charges en plus (montant main d'oeuvre et marchandises payées ensemble) puisque le RSI ne regarde que le montant du CA. Je ne peux dépasser les 32000€ annuels, si je fais cela pour chaque facture je dépasse ce montant et je dois changer de statut. Comment lui faire comprendre cela? Vous pouvez m'aider? Merci.