Conflit entre état des lieux entrée et sortie

Bonjour,
Je suis actuellement entrain de changer de logement, un appartement qui à présent est en gestion chez Foncia suite au rachat de mon ancien gestionnaire, Aurore Immobilier (qui a donc disparu). Il se trouve que le premier état des lieux fait avec Aurore I. était très évasif (3 lignes) et bien-sûr ne comprennait pas beaucoup de défauts de l'appartement (taches, fissures, meubles encombrants, etc.). Je n'ai pas fait cet état des lieux personnellement, mais un parent qui n'était pas au fait de l'importance sur sa précision.
Maintenant que je quitte les lieux, après avoir fait 2000 euros de travaux à mes frais (rénovation peinture, sol et éléctricité) quand je suis entrée dans l'appartement en 2007, on me récclame en plus de débarrasser les gros meubles (que je n'ai jamais pu retirer car une partie est fixée au mur) et de faire maintes réparations, le tout à mes frais, bien-sûr. Etant donné que l'état des lieux d'entrée est très évasif (il a été fait par un agent de Aurore I.) et que Foncia engage un expert très pointilleux, je risque d'être lésée malgré la remise à neuf que j'ai effectué. Il y a-t-il un recours suite à un état des lieux d'entrée mal fait? J'ai plus de 1000 euros de caution, et j'ai cru bien comprendre que l'intention de Foncia Ligurie était d'en garder le maximum, alors si je peux faire quelques chose, je le ferais. Merci pour vos conseils.