Réclamation de loyer après 7 mois

Bonjour à tous

je vis en appartement avec ma compagne depuis 2 ans et 1/2 maintenant.
Jusque là nous avions les allocations logement qui étaient versées directement sur le compte de notre propriétaire.

Le 1er janvier 2009 (environs) les allocations ont cessé d'être versées (suite à nos revenus en hausse).
Or nous n'avons jamais reçu de courrier de la part de la CAF pour nous prévenir. Ce n'est pas le plus grave dans l'absolue ...
En effet, notre propriétaire n'a pas vérifié ses comptes pendant x mois et aujourd'hui nous réclame de payer notre loyer complet (pas de soucis) mais surtout de rembourser tout ce qu'il manque depuis janvier soit près de 2000 euros.

Peut-on faire quelque chose hormis un arrangement à l'amiable qui n'est pas forcément envisageable ?

Merci d'avance pour votre aide