Remboursement transports en commun

Bonjour,
Étant en alternance, je prends mon véhicule pour aller en entreprise mais les transports en commun pour aller en cours.
Comme la loi l’indique, j’ai demandé un remboursement de 50% mais cela m’a été refusé car l’argument étant que lorsque je vais en entreprise, j’utilise ma voiture.
Ayant un doute, je voulais savoir s’ils sont en tord ou non....
Merci de votre aide.