Carte de séjour +transcription de papier?

Bonjour
Ca fait un an que min mari et moi on a fait une demande de regroupement familial. Il es résident en france depuis 25ans médecin. Et moi j'avais un visa touristique et donc en attendant notre demande de regroupement je fesais des allez retours . Mais je suis tombé enceinte et jusqu'au 7eme mois j'ai continuer à faire des aller retours après ce n'était plus possible ça jetait très fatigué et ma gyneco me l'a interdit. Donc je suis resté et j'ai accouché et le 17 octobre 2016 et je n'ai eu ma réponse de la part de l'offi de Bordeaux qu'en juillet 2017! Me disant que il faut refaire car je suis dejas sur le territoire français.
1ere question à qui faut il s'adresser pour avoir donc une carte de séjour?
2eme question faut il transcrire notre livret de famille car notre fils n'est pas inscrit sur le livret de famIlle algérien car la mairie nous a dit qu'ils avaient pas le droits d'y toucher .