Congés payés anticipés pris et pas salaire de base fiche de paie

Bonjour,
J'ai réalisée une rupture-conventionnelle avec mon employeur et une fois la rupture conventionnelle faites j'ai pris 4 semaines de congés payés en anticipé c'est a dire acquis pour la période du 1er juin 2015 a mai 2016 (ceux de l 'année dernière étant tous écoulés).
Petit soucis : sur ma feuille-de-paie reçu donc la derniere de cette entreprise, durant le mois ou j'étais en congés anticipé, ils me retire complètement ma base de salaire brut et elle est remplacé par" absence de congé payes" (dans retenue : salaire brut total xxxxx).
Après il me compte indemnités de congé payes pour le mois en gain ce qui fait qu'au lieu de me retrouver avec ma base de salaire + montant indemnités congé payes qu il restait a me payer soit 5 jours je me retrouve donc avec un salaire en dessous puis qu'il compte comme si j'étais absente durant la période ou j'ai pris des congés anticipés..
Il y a un problème non?
merci d'avance pour vos réponses