Déclaration RSI pôle emploi

Bonjour à tous,
Je n'ai pas réussi à trouver la réponse à mon problème sur les différents forums, du coup j'ai décidé de poster cette question.
Ma femme s'est inscrit comme auto-entrepreneuse l'année dernière (vers septembre 2013 environ). Elle est également inscrite au Pôle Emploi et perçoit des allocations chômage.
Dernièrement, ses allocations ont été réduites (elle perçoit environ 40% en moins), elle est allé demander le motif au Pôle Emploi et on lui a dit que c'est parce qu'ils n'ont pas reçu sa déclaration RSI (nous n'étions pas au courant qu'il fallait faire ceci).
Elle s'est donc inscrite au site net-entreprises et a souhaité faire sa déclaration, hors il dit que ce n'est pas possible de le faire avant mai 2014.
Elle ne peut pas attendre jusqu'à mai 2014 pour avoir l'attestation dont le Pôle Emploi a besoin pour lui rembourser 100% de ses allocations chômage.
De plus, je crains qu'elle soit pénalisé car elle n'a pas fait de déclaration sur ce site l'année dernière.
Bref, je vous remercie si vous pouvez nous aider à trouver une solution.
Cordialement,
Santi