Licenciement pour inaptitude ou rupture conventionnelle

bonjour,
Je suis employé comme menuisier dans une entreprise depuis bientot 5 ans et dû a un soucis de santé ( 2 opérations du genoux l'année dernière ) je ne peu plus reprendre mon poste à 100% , j'ai depuis la reconnaissance travailleur handicapé.

En ce moment je travail en mi temps thérapeutique mais pas sur la pose d'ouvertures juste sur le dépannage ( poste de secours en attendant la fin de mon mi temps ).

Mais le soucis c'est que je ne pourrais pas reprendre aprés le mi temps thérapeutique car trop physique du fait de mon opération , sachant que mon patron ne peu pas faire de poste adapté, faudait il que je fasse une rupture conventionnelle ou qu'il me licencie pour inaptitude?

Quel est le plus avantageux pour moi au niveau de mes droits , ai je le droit au prime de départ dans les deux cas ( je dépends de la convention collective commerce de détail non alimentaire ) et combien de préavis doit je faire ?

Merci d'avance