Refus de permis de construire par la DDT

Bonjour à tous,
Il y a deux ans nous avons acheter un terrain sur lequel nous souhaitons construire notre maison. Notre projet étant un mélange de toiture classique et toiture terrasse (50/50), le dossier à fait l'objet de longues discutions avec le conseil municipal et l'architecte conseil du parc naturel régional dont la commune fait parti. Ces deux années de concertation parfois houleuses ont donné lieu à un accord par le conseil municipal et le parc en fin d'année dernière, et le permis à été déposé dans la foulée.
C'était sans compter sur l'intervention de la DDT qui à émis un avis défavorable qui à eu pour conséquence de pousser le maire à refuser le permis.
La DDT nous reproche les 50% de toiture terrasse sous prétexte que le POS ne les autorise pas et que le projet ne s'intègre pas dans le site.
Mes questions sont les suivantes:
- Le POS étant le même pour tous les terrains du village, pourquoi des maisons à toiture terrasses partielles ou totales ont déjà été acceptées?
- Le POS n'interdisant pas formellement les toits terrasse, l'argument est il recevable?
- Un paragraphe du POS précise que "les constructions de style moderne sont acceptées si elles s'intègres dans leurs environnement"; un agent de la DDT est il compétant pour juger de l'intégration dans le site? l'architecte du parc n'est elle pas mieux placée pour en juger?

Le maire n'à pas donné son accord, suite à un entretient avec la DTT qui ne veut pas créé de précédant sur ce type de construction... mais n'est-ce pas déjà fait avec les autres permis acceptés?

Quels sont les recours? dois-je écrire au préfet ou au ministère de tutelle de la DDT?

Merci d'avance pour vos conseils.