Temps de mission / employeur voleur !

Bonjour,
Je suis en CDD depuis 3,5 mois / 6 et viens d'effectuer mon 1er déplacement dans le cadre de mon activité.
Or, je viens d'apprendre que le temps de déplacement professionnel (je ne parle pas ici du temps concernant le trajet domicile/travail mais bien de celui passé lors d'une mission) n'était comptabilisé qu'à moitié (pointage informatique des heures) à partir de 2 heures et plus de trajet. Ex. : j'ai effectué un déplacement en voiture avec mon boss de 9 heures (pauses comprises) et je ne dois pointer que la moitié du temps passé. La raison évoquée : il n'est pas possible d'imputer ce temps aux clients ! Du coup ce sont les petits salaries que nous sommes (smicards avec des heures pas possibles et magouilles des majorations des heures supp' à la clé, mais ceci est encore un autre sujet !) qui "offrons" ce précieux temps à nos patrons-voyous.
Ma question : est-ce légal dans la mesure où certains employés (ce sont tous, pardonnez-moi l'expression, des moutons) ont signé un "accord d'entreprise" il y a des années de ça, en sachant que lorsque j'ai signé mon contrat rien ne m'a été signifié ?

Je vous remercie pour votre aide.