Réglement appel de fond

Bonjour,
Nous venons d'avoir de gros travaux au niveau des parties communes de notre immeuble.
Les travaux ayant été effectués dans l'urgence, mais votés en assemblée générale extraordinaire, le syndic a envoyé l'appel de fond après la réalisation des travaux, avec les factures de l'entreprise.
Nous nous apercevons sur les factures de l'entreprise que des prestations prévues mais non réalisées nous sont facturées et que des prestations non prévues sont aussi facturées. Au final, la facture est du même montant que le devis, mais les travaux sont différents. Nous ne sommes pas d'accord pour payer les travaux non réalisés et les plus values non votées. Le syndic estime de son côté que l'entreprise a fait de son mieux dans l'urgence. Pouvons nous régler partiellement l'appel de fond, ou devons nous régler l'intégralité et contester, et si oui comment procéder.
Vous remerciant par avance pour vos réponses.