Absent au travail pour papiers administratifs

Bonjour,

je suis étudiante étrangère en contrat d'apprentissage. En période de formation, je me suis absentée pendant une journée puisque j'étais convoquée à la préfecture afin de récupérer ma nouvelle carte de séjour.
Mon employeur me dit que ma journée d'absence en formation sera déduite de mon salaire.
A t-il le droit de faire ça? Comment pourrais-je réfuter ce qu'il compte faire à mon salaire à la fin du mois?

Je devais être à la préfecture et aucune lettre de dérogation n'est possible pour récupérer une carte de séjour, sauf pour cause maladie.

Merci