Virement et chèque

Bonjour,

Je suis vendeuse dans une chaine de prêt à porter pour femme depuis bientôt deux ans et régulièrement je reçois une partie de ma paye par virement et un complément par chèque qui figure sur ma fiche de paye. Seulement dans la case Net à payer ne figure que le montant du virement. Est-ce légal? Est-ce que cela pose problème pour la cotisation de ma retraite?
Mes collègues reçoivent la totalité de leur paye par virement et n'ont jamais eu ce problème...