Congés en Bac pro alternance

Bonjour,
mon fils est en bac pro alternance. Il a commencé chez le patron le 1er septembre 2008. Son patron, ne lui a accordé que 4j 1/2 de vacances au 31 avril, au lieu de 2,25 x 9 mois au 31 mai. Peut il lui payer ? ou mon fils peut il prendre ses congés après le 31 mai ? SI son patron lui refuse les congés qu'il lui devait au 31 mai, que peut on faire ? Merci de m'éclairer.